Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF3FO00303 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EIF3FO00303 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF3FO00303 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3FO00303 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3FO00303 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3FO00303 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3FO00303 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EIF3FO00303 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms