Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX16-NPEPL1H3BU86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STX16-NPEPL1H3BU86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX16-NPEPL1H3BU86 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX16-NPEPL1H3BU86 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX16-NPEPL1H3BU86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX16-NPEPL1H3BU86 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX16-NPEPL1H3BU86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX16-NPEPL1H3BU86 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms