Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.06■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.91■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms