Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.63■■■■■ 6.34
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.08■■■■■ 6.25
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.38■■■■■ 6.14
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.49■■■■■ 5.99
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.67■■■■■ 5.86
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.36■■■■■ 5.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.36■■■■■ 5.81
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.18■■■■■ 5.62
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.11■■■■■ 5.61
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.4■■■■■ 5.5
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.3■■■■■ 5.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.28■■■■■ 5.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.28■■■■■ 5.48
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC49.06■■■■■ 5.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.04■■■■■ 5.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.49■■■■■ 5.19
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.44■■■■■ 5.18
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.29■■■■■ 5.16
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.24■■■■■ 5.15
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC47.09■■■■■ 5.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47■■■■■ 5.11
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.79■■■■■ 5.08
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms