Protein–RNA interactions for Protein: E5RJ46

C8orf87, Uncharacterized protein C8orf87, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf87E5RJ46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf87E5RJ46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf87E5RJ46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf87E5RJ46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf87E5RJ46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C8orf87E5RJ46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms