Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRRM4A7MD48 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRM4A7MD48 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRM4A7MD48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRM4A7MD48 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRRM4A7MD48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM4A7MD48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRRM4A7MD48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM4A7MD48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM4A7MD48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM4A7MD48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRRM4A7MD48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRRM4A7MD48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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