Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A7PA6NKC0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A7PA6NKC0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM90A7PA6NKC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A7PA6NKC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM90A7PA6NKC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM90A7PA6NKC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms