Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP17L4A6NCW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP17L4A6NCW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP17L4A6NCW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP17L4A6NCW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP17L4A6NCW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP17L4A6NCW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP17L4A6NCW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP17L4A6NCW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP17L4A6NCW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP17L4A6NCW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP17L4A6NCW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP17L4A6NCW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP17L4A6NCW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP17L4A6NCW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP17L4A6NCW7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP17L4A6NCW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP17L4A6NCW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP17L4A6NCW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
USP17L4A6NCW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms