Protein–RNA interactions for Protein: A4D174

C7orf71, Putative uncharacterized protein C7orf71, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf71A4D174 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C7orf71A4D174 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C7orf71A4D174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C7orf71A4D174 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C7orf71A4D174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C7orf71A4D174 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C7orf71A4D174 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms