Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQK1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQK1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQK1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQK1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A0U1RQK1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RQK1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms