Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 GSKIP-206ENST00000555757 361 ntTSL 35.82□□□□□ -1.486e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.956e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 518.49■□□□□ 0.553e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 311.72□□□□□ -0.533e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 311.72□□□□□ -0.533e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 511.56□□□□□ -0.563e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.593e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 29.25□□□□□ -0.933e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.013e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 38.77□□□□□ -1.013e-13■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-13■■■■■ 42.6
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SF3B4Q15427 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.051e-10■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 KLHL36-203ENST00000564159 2618 ntTSL 213.85□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 42.6
SF3B4Q15427 KLHL36-202ENST00000325279 6488 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 42.6
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SF3B4Q15427 CYB561A3-205ENST00000535177 1026 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.364e-8■■■■■ 42.5
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SF3B4Q15427 CYB561A3-201ENST00000294072 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 42.5
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SF3B4Q15427 NKTR-205ENST00000459950 2134 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 42.5
SF3B4Q15427 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.129e-12■■■■■ 42.5
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SF3B4Q15427 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 42.4
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SF3B4Q15427 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.028e-13■■■■■ 42.4
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SF3B4Q15427 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.378e-13■■■■■ 42.4
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SF3B4Q15427 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.388e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.448e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 FAM3B-205ENST00000479810 2742 ntTSL 211.17□□□□□ -0.628e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 PRCC-207ENST00000526188 634 ntTSL 29.98□□□□□ -0.818e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 ABHD16A-205ENST00000471644 746 ntTSL 39.93□□□□□ -0.828e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 FAM3B-202ENST00000398646 1026 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.038e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 EIF3B-208ENST00000466199 734 ntTSL 28.26□□□□□ -1.098e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.115e-11■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 WDR26-202ENST00000443112 1306 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.288e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 PRCC-203ENST00000459707 557 ntTSL 26.03□□□□□ -1.448e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 54.96□□□□□ -1.628e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 WDR26-204ENST00000477425 529 ntTSL 33.95□□□□□ -1.788e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 WDR26-209ENST00000489825 751 ntTSL 52.85□□□□□ -1.958e-13■■■■■ 42.4
SF3B4Q15427 SLCO4A1-204ENST00000466818 556 ntTSL 38.17□□□□□ -1.13e-12■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 FAAP100-207ENST00000545865 689 ntTSL 211.16□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 TNRC6A-215ENST00000568903 943 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-9■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 TNRC6A-212ENST00000567232 523 ntTSL 57.67□□□□□ -1.185e-9■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 VILL-206ENST00000463080 831 ntTSL 519.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 VILL-208ENST00000484717 2072 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 VILL-203ENST00000412008 813 ntTSL 310.28□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 42.3
SF3B4Q15427 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-12■■■■■ 42.2
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 3984.6 ms