RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530721.5

RPS3-216, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-216ENST00000530721 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.87■■■□□ 2.69
RPS3-216ENST00000530721 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.54■■■□□ 2.16
RPS3-216ENST00000530721 ABCC9O60706 1549 aa28.34■■■□□ 2.13
RPS3-216ENST00000530721 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.08■■□□□ 1.93
RPS3-216ENST00000530721 NACADO15069 1562 aa26.94■■□□□ 1.9
RPS3-216ENST00000530721 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.81■■□□□ 1.88
RPS3-216ENST00000530721 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.65■■□□□ 1.86
RPS3-216ENST00000530721 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
RPS3-216ENST00000530721 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS3-216ENST00000530721 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS3-216ENST00000530721 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
RPS3-216ENST00000530721 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.36■■□□□ 1.81
RPS3-216ENST00000530721 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.26■■□□□ 1.79
RPS3-216ENST00000530721 SCRIBQ14160 1630 aa25.99■■□□□ 1.75
RPS3-216ENST00000530721 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
RPS3-216ENST00000530721 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS3-216ENST00000530721 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RPS3-216ENST00000530721 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS3-216ENST00000530721 NCAPD3P42695 1498 aa24.87■■□□□ 1.57
RPS3-216ENST00000530721 SMARCA4P51532 1647 aa24.83■■□□□ 1.56
RPS3-216ENST00000530721 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.81■■□□□ 1.56
RPS3-216ENST00000530721 SMARCA2P51531 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
RPS3-216ENST00000530721 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RPS3-216ENST00000530721 HMGXB3Q12766 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS3-216ENST00000530721 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.6■■□□□ 1.53
RPS3-216ENST00000530721 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
RPS3-216ENST00000530721 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.54■■□□□ 1.52
RPS3-216ENST00000530721 ERCC6Q03468 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
RPS3-216ENST00000530721 NESP48681 1621 aa24.39■■□□□ 1.5
RPS3-216ENST00000530721 CUX2O14529 1486 aa24.39■■□□□ 1.5
RPS3-216ENST00000530721 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.29■■□□□ 1.48
RPS3-216ENST00000530721 WIZO95785 1651 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS3-216ENST00000530721 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.17■■□□□ 1.46
RPS3-216ENST00000530721 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.15■■□□□ 1.46
RPS3-216ENST00000530721 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RPS3-216ENST00000530721 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.13■■□□□ 1.45
RPS3-216ENST00000530721 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RPS3-216ENST00000530721 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.08■■□□□ 1.45
RPS3-216ENST00000530721 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
RPS3-216ENST00000530721 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.92■■□□□ 1.42
RPS3-216ENST00000530721 CFTRP13569 1480 aa23.88■■□□□ 1.41
RPS3-216ENST00000530721 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.86■■□□□ 1.41
RPS3-216ENST00000530721 WDR62O43379 1518 aa23.85■■□□□ 1.41
RPS3-216ENST00000530721 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.84■■□□□ 1.41
RPS3-216ENST00000530721 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.69■■□□□ 1.38
RPS3-216ENST00000530721 PRDM2Q13029 1718 aa23.64■■□□□ 1.38
RPS3-216ENST00000530721 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RPS3-216ENST00000530721 TOPBP1Q92547 1522 aa23.41■■□□□ 1.34
RPS3-216ENST00000530721 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
RPS3-216ENST00000530721 IFT140Q96RY7 1462 aa23.38■■□□□ 1.33
RPS3-216ENST00000530721 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.34■■□□□ 1.33
RPS3-216ENST00000530721 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
RPS3-216ENST00000530721 OSCARQ8IYS5 282 aa23.3■■□□□ 1.32
RPS3-216ENST00000530721 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS3-216ENST00000530721 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS3-216ENST00000530721 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS3-216ENST00000530721 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS3-216ENST00000530721 TRIM41Q8WV44 630 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS3-216ENST00000530721 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 28
RPS3-216ENST00000530721 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS3-216ENST00000530721 SOGA1O94964 1423 aa23.08■■□□□ 1.28
RPS3-216ENST00000530721 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS3-216ENST00000530721 CUX1P39880 1505 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS3-216ENST00000530721 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 WDR97A6NE52 1622 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 CHD1O14646 1710 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS3-216ENST00000530721 FBLN2P98095 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
RPS3-216ENST00000530721 ARHGEF11O15085 1522 aa22.92■■□□□ 1.26
RPS3-216ENST00000530721 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.89■■□□□ 1.25
RPS3-216ENST00000530721 GRIN2BQ13224 1484 aa22.87■■□□□ 1.25
RPS3-216ENST00000530721 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS3-216ENST00000530721 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS3-216ENST00000530721 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS3-216ENST00000530721 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS3-216ENST00000530721 SYNJ2O15056 1496 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS3-216ENST00000530721 PBRM1Q86U86 1689 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS3-216ENST00000530721 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.238e-7■□□□□ 9.9
RPS3-216ENST00000530721 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 SYNJ1O43426 1573 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 TOP2BQ02880 1626 aa22.75■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.73■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS3-216ENST00000530721 ARAP1Q96P48 1450 aa22.7■■□□□ 1.22
RPS3-216ENST00000530721 ADAMTS12P58397 1594 aa22.58■■□□□ 1.2
RPS3-216ENST00000530721 GRIN2AQ12879 1464 aa22.57■■□□□ 1.2
RPS3-216ENST00000530721 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.54■■□□□ 1.2
RPS3-216ENST00000530721 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.53■■□□□ 1.2
RPS3-216ENST00000530721 NUP160Q12769 1436 aa22.49■■□□□ 1.19
RPS3-216ENST00000530721 CEP170Q5SW79 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
RPS3-216ENST00000530721 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RPS3-216ENST00000530721 SHROOM2Q13796 1616 aa22.36■■□□□ 1.17
RPS3-216ENST00000530721 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.36■■□□□ 1.17
RPS3-216ENST00000530721 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
RPS3-216ENST00000530721 IGF1RP08069 1367 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS3-216ENST00000530721 JPH4Q96JJ6 628 aa22.26■■□□□ 1.15
RPS3-216ENST00000530721 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms