RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.92■■■■□ 3.34
PRCC-201ENST00000271526 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.7■■■□□ 2.5
PRCC-201ENST00000271526 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PRCC-201ENST00000271526 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.07■■■□□ 2.4
PRCC-201ENST00000271526 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.72■■■□□ 2.35
PRCC-201ENST00000271526 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PRCC-201ENST00000271526 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.21■■■□□ 2.27
PRCC-201ENST00000271526 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.17■■■□□ 2.26
PRCC-201ENST00000271526 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.1■■■□□ 2.25
PRCC-201ENST00000271526 HRCP23327 699 aa29.03■■■□□ 2.24
PRCC-201ENST00000271526 ABCC9O60706 1549 aa28.65■■■□□ 2.18
PRCC-201ENST00000271526 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.54■■■□□ 2.16
PRCC-201ENST00000271526 SCRIBQ14160 1630 aa28.4■■■□□ 2.14
PRCC-201ENST00000271526 NACADO15069 1562 aa28.36■■■□□ 2.13
PRCC-201ENST00000271526 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PRCC-201ENST00000271526 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PRCC-201ENST00000271526 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.12■■■□□ 2.09
PRCC-201ENST00000271526 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
PRCC-201ENST00000271526 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PRCC-201ENST00000271526 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.86■■■□□ 2.05
PRCC-201ENST00000271526 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.82■■■□□ 2.04
PRCC-201ENST00000271526 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PRCC-201ENST00000271526 TRIM41Q8WV44 630 aa27.66■■■□□ 2.02
PRCC-201ENST00000271526 WIZO95785 1651 aa27.62■■■□□ 2.01
PRCC-201ENST00000271526 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PRCC-201ENST00000271526 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PRCC-201ENST00000271526 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PRCC-201ENST00000271526 SMARCA4P51532 1647 aa27.34■■□□□ 1.97
PRCC-201ENST00000271526 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.33■■□□□ 1.97
PRCC-201ENST00000271526 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PRCC-201ENST00000271526 SMARCA2P51531 1590 aa27.15■■□□□ 1.94
PRCC-201ENST00000271526 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PRCC-201ENST00000271526 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.14■■□□□ 1.93
PRCC-201ENST00000271526 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.06■■□□□ 1.92
PRCC-201ENST00000271526 PEG3Q9GZU2 1588 aa27■■□□□ 1.91
PRCC-201ENST00000271526 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PRCC-201ENST00000271526 ABCC8Q09428 1581 aa26.89■■□□□ 1.9
PRCC-201ENST00000271526 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.82■■□□□ 1.88
PRCC-201ENST00000271526 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
PRCC-201ENST00000271526 EEA1Q15075 1411 aa26.82■■□□□ 1.88
PRCC-201ENST00000271526 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PRCC-201ENST00000271526 SOGA1O94964 1423 aa26.68■■□□□ 1.86
PRCC-201ENST00000271526 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.68■■□□□ 1.86
PRCC-201ENST00000271526 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PRCC-201ENST00000271526 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PRCC-201ENST00000271526 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.64■■□□□ 1.85
PRCC-201ENST00000271526 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PRCC-201ENST00000271526 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.59■■□□□ 1.85
PRCC-201ENST00000271526 CEP162Q5TB80 1403 aa26.58■■□□□ 1.85
PRCC-201ENST00000271526 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
PRCC-201ENST00000271526 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PRCC-201ENST00000271526 GOLGA3Q08378 1498 aa26.48■■□□□ 1.83
PRCC-201ENST00000271526 NEUROD1Q13562 356 aa26.47■■□□□ 1.83
PRCC-201ENST00000271526 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
PRCC-201ENST00000271526 SYNJ1O43426 1573 aa26.45■■□□□ 1.82
PRCC-201ENST00000271526 KIF21BO75037 1637 aa26.41■■□□□ 1.82
PRCC-201ENST00000271526 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PRCC-201ENST00000271526 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.36■■□□□ 1.81
PRCC-201ENST00000271526 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRCC-201ENST00000271526 TOP2BQ02880 1626 aa26.24■■□□□ 1.79
PRCC-201ENST00000271526 HMGXB3Q12766 1538 aa26.24■■□□□ 1.79
PRCC-201ENST00000271526 NCAPD3P42695 1498 aa26.23■■□□□ 1.79
PRCC-201ENST00000271526 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.23■■□□□ 1.79
PRCC-201ENST00000271526 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.18■■□□□ 1.78
PRCC-201ENST00000271526 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PRCC-201ENST00000271526 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PRCC-201ENST00000271526 CLIP1P30622 1438 aa26.11■■□□□ 1.77
PRCC-201ENST00000271526 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.07■■□□□ 1.76
PRCC-201ENST00000271526 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.06■■□□□ 1.76
PRCC-201ENST00000271526 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.02■■□□□ 1.76
PRCC-201ENST00000271526 PRXQ9BXM0 1461 aa25.99■■□□□ 1.75
PRCC-201ENST00000271526 CFTRP13569 1480 aa25.96■■□□□ 1.75
PRCC-201ENST00000271526 MYT1Q01538 1121 aa25.95■■□□□ 1.74
PRCC-201ENST00000271526 CUX1P39880 1505 aa25.92■■□□□ 1.74
PRCC-201ENST00000271526 MIER1Q8N108 512 aa25.81■■□□□ 1.72
PRCC-201ENST00000271526 KIF27Q86VH2 1401 aa25.8■■□□□ 1.72
PRCC-201ENST00000271526 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PRCC-201ENST00000271526 PRDM2Q13029 1718 aa25.78■■□□□ 1.72
PRCC-201ENST00000271526 ARAP1Q96P48 1450 aa25.75■■□□□ 1.71
PRCC-201ENST00000271526 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.73■■□□□ 1.71
PRCC-201ENST00000271526 APLP2Q06481 763 aa25.73■■□□□ 1.71
PRCC-201ENST00000271526 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PRCC-201ENST00000271526 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.63■■□□□ 1.69
PRCC-201ENST00000271526 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PRCC-201ENST00000271526 IGF1RP08069 1367 aa25.54■■□□□ 1.68
PRCC-201ENST00000271526 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.53■■□□□ 1.68
PRCC-201ENST00000271526 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PRCC-201ENST00000271526 CUX2O14529 1486 aa25.5■■□□□ 1.67
PRCC-201ENST00000271526 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRCC-201ENST00000271526 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PRCC-201ENST00000271526 MAP3K1Q13233 1512 aa25.45■■□□□ 1.66
PRCC-201ENST00000271526 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
PRCC-201ENST00000271526 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.4■■□□□ 1.66
PRCC-201ENST00000271526 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.38■■□□□ 1.65
PRCC-201ENST00000271526 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.31■■□□□ 1.64
PRCC-201ENST00000271526 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.3■■□□□ 1.64
PRCC-201ENST00000271526 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.28■■□□□ 1.64
PRCC-201ENST00000271526 TIAM1Q13009 1591 aa25.27■■□□□ 1.64
PRCC-201ENST00000271526 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.25■■□□□ 1.63
PRCC-201ENST00000271526 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms