RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527446.5

RPS3-209, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS3, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-209ENST00000527446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS3-209ENST00000527446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS3-209ENST00000527446 ABCC9O60706 1549 aa25.82■■□□□ 1.72
RPS3-209ENST00000527446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RPS3-209ENST00000527446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS3-209ENST00000527446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS3-209ENST00000527446 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS3-209ENST00000527446 NACADO15069 1562 aa25.08■■□□□ 1.61
RPS3-209ENST00000527446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS3-209ENST00000527446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.47■■□□□ 1.51
RPS3-209ENST00000527446 SCRIBQ14160 1630 aa24.45■■□□□ 1.51
RPS3-209ENST00000527446 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS3-209ENST00000527446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
RPS3-209ENST00000527446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.2■■□□□ 1.46
RPS3-209ENST00000527446 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.63■■□□□ 1.37
RPS3-209ENST00000527446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RPS3-209ENST00000527446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RPS3-209ENST00000527446 SMARCA4P51532 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
RPS3-209ENST00000527446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.42■■□□□ 1.34
RPS3-209ENST00000527446 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.42■■□□□ 1.34
RPS3-209ENST00000527446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.38■■□□□ 1.33
RPS3-209ENST00000527446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
RPS3-209ENST00000527446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS3-209ENST00000527446 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS3-209ENST00000527446 SMARCA2P51531 1590 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS3-209ENST00000527446 NCAPD3P42695 1498 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS3-209ENST00000527446 WIZO95785 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS3-209ENST00000527446 HMGXB3Q12766 1538 aa23.06■■□□□ 1.28
RPS3-209ENST00000527446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RPS3-209ENST00000527446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RPS3-209ENST00000527446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPS3-209ENST00000527446 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.69■■□□□ 1.22
RPS3-209ENST00000527446 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
RPS3-209ENST00000527446 NESP48681 1621 aa22.49■■□□□ 1.19
RPS3-209ENST00000527446 CFTRP13569 1480 aa22.47■■□□□ 1.19
RPS3-209ENST00000527446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.44■■□□□ 1.18
RPS3-209ENST00000527446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS3-209ENST00000527446 PRDM2Q13029 1718 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS3-209ENST00000527446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.23■■□□□ 1.15
RPS3-209ENST00000527446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.19■■□□□ 1.14
RPS3-209ENST00000527446 ERCC6Q03468 1493 aa22.17■■□□□ 1.14
RPS3-209ENST00000527446 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.13■■□□□ 1.13
RPS3-209ENST00000527446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RPS3-209ENST00000527446 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.03■■□□□ 1.12
RPS3-209ENST00000527446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RPS3-209ENST00000527446 WDR62O43379 1518 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS3-209ENST00000527446 ABCC8Q09428 1581 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS3-209ENST00000527446 CUX1P39880 1505 aa21.94■■□□□ 1.1
RPS3-209ENST00000527446 TOPBP1Q92547 1522 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS3-209ENST00000527446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.18e-7■□□□□ 9.9
RPS3-209ENST00000527446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS3-209ENST00000527446 SYNJ1O43426 1573 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS3-209ENST00000527446 TOP2BQ02880 1626 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS3-209ENST00000527446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS3-209ENST00000527446 CUX2O14529 1486 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS3-209ENST00000527446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS3-209ENST00000527446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS3-209ENST00000527446 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS3-209ENST00000527446 SOGA1O94964 1423 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS3-209ENST00000527446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS3-209ENST00000527446 IFT140Q96RY7 1462 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS3-209ENST00000527446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
RPS3-209ENST00000527446 TRIM41Q8WV44 630 aa21.67■■□□□ 1.06
RPS3-209ENST00000527446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.59■■□□□ 1.05
RPS3-209ENST00000527446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
RPS3-209ENST00000527446 WDR97A6NE52 1622 aa21.57■■□□□ 1.04
RPS3-209ENST00000527446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
RPS3-209ENST00000527446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 28
RPS3-209ENST00000527446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS3-209ENST00000527446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS3-209ENST00000527446 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS3-209ENST00000527446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS3-209ENST00000527446 KIF27Q86VH2 1401 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS3-209ENST00000527446 GRIN2BQ13224 1484 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS3-209ENST00000527446 IGF1RP08069 1367 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS3-209ENST00000527446 PBRM1Q86U86 1689 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS3-209ENST00000527446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.33■■□□□ 1
RPS3-209ENST00000527446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.29■■□□□ 1
RPS3-209ENST00000527446 EEA1Q15075 1411 aa21.27■■□□□ 1
RPS3-209ENST00000527446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RPS3-209ENST00000527446 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.22■□□□□ 0.99
RPS3-209ENST00000527446 ADAMTS12P58397 1594 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS3-209ENST00000527446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RPS3-209ENST00000527446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.21■□□□□ 0.99
RPS3-209ENST00000527446 SYNJ2O15056 1496 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS3-209ENST00000527446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS3-209ENST00000527446 CUL7Q14999 1698 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS3-209ENST00000527446 PRXQ9BXM0 1461 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS3-209ENST00000527446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
RPS3-209ENST00000527446 CHD1O14646 1710 aa21.12■□□□□ 0.97
RPS3-209ENST00000527446 FBLN2P98095 1184 aa21.1■□□□□ 0.97
RPS3-209ENST00000527446 GRIN2AQ12879 1464 aa21.1■□□□□ 0.97
RPS3-209ENST00000527446 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.09■□□□□ 0.97
RPS3-209ENST00000527446 KIF21BO75037 1637 aa21.03■□□□□ 0.96
RPS3-209ENST00000527446 NUP160Q12769 1436 aa21.02■□□□□ 0.95
RPS3-209ENST00000527446 OSCARQ8IYS5 282 aa21.01■□□□□ 0.95
RPS3-209ENST00000527446 CEP170Q5SW79 1584 aa20.99■□□□□ 0.95
RPS3-209ENST00000527446 GOLGA3Q08378 1498 aa20.93■□□□□ 0.94
RPS3-209ENST00000527446 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.93■□□□□ 0.94
RPS3-209ENST00000527446 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.9■□□□□ 0.94
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