Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZCCHC17Q9NP64 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZCCHC17Q9NP64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZCCHC17Q9NP64 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms