RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-222ENST00000589235 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.47■■■■■ 5.99
CIRBP-222ENST00000589235 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.9■■■■■ 5.1
CIRBP-222ENST00000589235 ABCC9O60706 1549 aa46.6■■■■■ 5.05
CIRBP-222ENST00000589235 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.56■■■■■ 4.72
CIRBP-222ENST00000589235 NACADO15069 1562 aa44.35■■■■■ 4.69
CIRBP-222ENST00000589235 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.31■■■■■ 4.68
CIRBP-222ENST00000589235 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.86■■■■■ 4.61
CIRBP-222ENST00000589235 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
CIRBP-222ENST00000589235 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.49■■■■■ 4.551e-14■■□□□ 14.3
CIRBP-222ENST00000589235 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.39■■■■■ 4.54
CIRBP-222ENST00000589235 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.37■■■■■ 4.53
CIRBP-222ENST00000589235 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.31■■■■■ 4.52
CIRBP-222ENST00000589235 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.1■■■■■ 4.49
CIRBP-222ENST00000589235 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.74■■■■■ 4.43
CIRBP-222ENST00000589235 SCRIBQ14160 1630 aa42.74■■■■■ 4.43
CIRBP-222ENST00000589235 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
CIRBP-222ENST00000589235 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.08■■■■■ 4.33
CIRBP-222ENST00000589235 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.99■■■■■ 4.31
CIRBP-222ENST00000589235 NCAPD3P42695 1498 aa40.94■■■■■ 4.14
CIRBP-222ENST00000589235 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.83■■■■■ 4.13
CIRBP-222ENST00000589235 SMARCA4P51532 1647 aa40.81■■■■■ 4.12
CIRBP-222ENST00000589235 SMARCA2P51531 1590 aa40.77■■■■■ 4.12
CIRBP-222ENST00000589235 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
CIRBP-222ENST00000589235 HMGXB3Q12766 1538 aa40.62■■■■■ 4.09
CIRBP-222ENST00000589235 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
CIRBP-222ENST00000589235 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.44■■■■■ 4.06
CIRBP-222ENST00000589235 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.39■■■■■ 4.06
CIRBP-222ENST00000589235 ERCC6Q03468 1493 aa40.32■■■■■ 4.04
CIRBP-222ENST00000589235 CUX2O14529 1486 aa40.1■■■■■ 4.01
CIRBP-222ENST00000589235 NESP48681 1621 aa40.07■■■■■ 4.01
CIRBP-222ENST00000589235 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.93■■■■□ 3.98
CIRBP-222ENST00000589235 WIZO95785 1651 aa39.88■■■■□ 3.97
CIRBP-222ENST00000589235 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.8■■■■□ 3.96
CIRBP-222ENST00000589235 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.74■■■■□ 3.95
CIRBP-222ENST00000589235 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
CIRBP-222ENST00000589235 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.72■■■■□ 3.95
CIRBP-222ENST00000589235 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
CIRBP-222ENST00000589235 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.51■■■■□ 3.92
CIRBP-222ENST00000589235 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CIRBP-222ENST00000589235 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.35■■■■□ 3.89
CIRBP-222ENST00000589235 CFTRP13569 1480 aa39.31■■■■□ 3.88
CIRBP-222ENST00000589235 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.27■■■■□ 3.88
CIRBP-222ENST00000589235 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.24■■■■□ 3.87
CIRBP-222ENST00000589235 WDR62O43379 1518 aa39.19■■■■□ 3.86
CIRBP-222ENST00000589235 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.05■■■■□ 3.84
CIRBP-222ENST00000589235 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
CIRBP-222ENST00000589235 PRDM2Q13029 1718 aa38.8■■■■□ 3.8
CIRBP-222ENST00000589235 ABCC8Q09428 1581 aa38.58■■■■□ 3.77
CIRBP-222ENST00000589235 TOPBP1Q92547 1522 aa38.51■■■■□ 3.76
CIRBP-222ENST00000589235 IFT140Q96RY7 1462 aa38.5■■■■□ 3.75
CIRBP-222ENST00000589235 OSCARQ8IYS5 282 aa38.43■■■■□ 3.74
CIRBP-222ENST00000589235 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.4■■■■□ 3.74
CIRBP-222ENST00000589235 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
CIRBP-222ENST00000589235 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
CIRBP-222ENST00000589235 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
CIRBP-222ENST00000589235 TRIM41Q8WV44 630 aa38.13■■■■□ 3.69
CIRBP-222ENST00000589235 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
CIRBP-222ENST00000589235 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
CIRBP-222ENST00000589235 SOGA1O94964 1423 aa38.05■■■■□ 3.68
CIRBP-222ENST00000589235 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.682e-10■■■■■ 31.7
CIRBP-222ENST00000589235 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.98■■■■□ 3.67
CIRBP-222ENST00000589235 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.95■■■■□ 3.67
CIRBP-222ENST00000589235 CUX1P39880 1505 aa37.92■■■■□ 3.66
CIRBP-222ENST00000589235 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CIRBP-222ENST00000589235 FBLN2P98095 1184 aa37.86■■■■□ 3.65
CIRBP-222ENST00000589235 WDR97A6NE52 1622 aa37.83■■■■□ 3.65
CIRBP-222ENST00000589235 CHD1O14646 1710 aa37.68■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.68■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.68■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.68■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 GRIN2BQ13224 1484 aa37.67■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.66■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 ARHGEF11O15085 1522 aa37.64■■■■□ 3.62
CIRBP-222ENST00000589235 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
CIRBP-222ENST00000589235 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.57■■■■□ 3.6
CIRBP-222ENST00000589235 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.56■■■■□ 3.6
CIRBP-222ENST00000589235 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.55■■■■□ 3.61e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-222ENST00000589235 SYNJ2O15056 1496 aa37.49■■■■□ 3.59
CIRBP-222ENST00000589235 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.46■■■■□ 3.59
CIRBP-222ENST00000589235 TOP2BQ02880 1626 aa37.43■■■■□ 3.58
CIRBP-222ENST00000589235 SYNJ1O43426 1573 aa37.43■■■■□ 3.58
CIRBP-222ENST00000589235 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.4■■■■□ 3.58
CIRBP-222ENST00000589235 PBRM1Q86U86 1689 aa37.4■■■■□ 3.58
CIRBP-222ENST00000589235 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.39■■■■□ 3.58
CIRBP-222ENST00000589235 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
CIRBP-222ENST00000589235 ARAP1Q96P48 1450 aa37.26■■■■□ 3.56
CIRBP-222ENST00000589235 GRIN2AQ12879 1464 aa37.13■■■■□ 3.54
CIRBP-222ENST00000589235 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.13■■■■□ 3.53
CIRBP-222ENST00000589235 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.11■■■■□ 3.53
CIRBP-222ENST00000589235 ADAMTS12P58397 1594 aa37.1■■■■□ 3.53
CIRBP-222ENST00000589235 NUP160Q12769 1436 aa37■■■■□ 3.51
CIRBP-222ENST00000589235 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
CIRBP-222ENST00000589235 CEP170Q5SW79 1584 aa36.91■■■■□ 3.5
CIRBP-222ENST00000589235 KIF27Q86VH2 1401 aa36.85■■■■□ 3.49
CIRBP-222ENST00000589235 IGF1RP08069 1367 aa36.74■■■■□ 3.47
CIRBP-222ENST00000589235 JPH4Q96JJ6 628 aa36.73■■■■□ 3.47
CIRBP-222ENST00000589235 SHROOM2Q13796 1616 aa36.73■■■■□ 3.47
CIRBP-222ENST00000589235 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.7■■■■□ 3.47
CIRBP-222ENST00000589235 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
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