RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304062.10

CPLX1-201, Transcript of complexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPLX1, Length 2,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPLX1-201ENST00000304062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.36■■■■■ 5.81
CPLX1-201ENST00000304062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.97■■■■■ 4.79
CPLX1-201ENST00000304062 ABCC9O60706 1549 aa43.62■■■■■ 4.57
CPLX1-201ENST00000304062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.03■■■■■ 4.48
CPLX1-201ENST00000304062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CPLX1-201ENST00000304062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.22■■■■■ 4.35
CPLX1-201ENST00000304062 NACADO15069 1562 aa42.08■■■■■ 4.33
CPLX1-201ENST00000304062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.96■■■■■ 4.31
CPLX1-201ENST00000304062 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
CPLX1-201ENST00000304062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.78■■■■■ 4.28
CPLX1-201ENST00000304062 SCRIBQ14160 1630 aa41.61■■■■■ 4.25
CPLX1-201ENST00000304062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.32■■■■■ 4.21
CPLX1-201ENST00000304062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.17
CPLX1-201ENST00000304062 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.89■■■■■ 4.14
CPLX1-201ENST00000304062 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.19■■■■■ 4.02
CPLX1-201ENST00000304062 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
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CPLX1-201ENST00000304062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
CPLX1-201ENST00000304062 SMARCA4P51532 1647 aa39.67■■■■□ 3.94
CPLX1-201ENST00000304062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
CPLX1-201ENST00000304062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
CPLX1-201ENST00000304062 WIZO95785 1651 aa39.47■■■■□ 3.91
CPLX1-201ENST00000304062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.34■■■■□ 3.89
CPLX1-201ENST00000304062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.34■■■■□ 3.89
CPLX1-201ENST00000304062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.22■■■■□ 3.87
CPLX1-201ENST00000304062 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.06■■■■□ 3.84
CPLX1-201ENST00000304062 SMARCA2P51531 1590 aa39.03■■■■□ 3.84
CPLX1-201ENST00000304062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
CPLX1-201ENST00000304062 NCAPD3P42695 1498 aa38.9■■■■□ 3.82
CPLX1-201ENST00000304062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
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CPLX1-201ENST00000304062 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.58■■■■□ 3.77
CPLX1-201ENST00000304062 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.55■■■■□ 3.76
CPLX1-201ENST00000304062 HRCP23327 699 aa38.29■■■■□ 3.72
CPLX1-201ENST00000304062 NESP48681 1621 aa38.11■■■■□ 3.69
CPLX1-201ENST00000304062 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.91■■■■□ 3.66
CPLX1-201ENST00000304062 CFTRP13569 1480 aa37.87■■■■□ 3.65
CPLX1-201ENST00000304062 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.75■■■■□ 3.63
CPLX1-201ENST00000304062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.69■■■■□ 3.62
CPLX1-201ENST00000304062 ABCC8Q09428 1581 aa37.65■■■■□ 3.62
CPLX1-201ENST00000304062 PRDM2Q13029 1718 aa37.57■■■■□ 3.6
CPLX1-201ENST00000304062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.55■■■■□ 3.6
CPLX1-201ENST00000304062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.54■■■■□ 3.6
CPLX1-201ENST00000304062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.42■■■■□ 3.58
CPLX1-201ENST00000304062 ERCC6Q03468 1493 aa37.35■■■■□ 3.57
CPLX1-201ENST00000304062 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.35■■■■□ 3.57
CPLX1-201ENST00000304062 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.29■■■■□ 3.56
CPLX1-201ENST00000304062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
CPLX1-201ENST00000304062 SYNJ1O43426 1573 aa37.28■■■■□ 3.56
CPLX1-201ENST00000304062 CUX1P39880 1505 aa37.23■■■■□ 3.55
CPLX1-201ENST00000304062 TRIM41Q8WV44 630 aa37.21■■■■□ 3.55
CPLX1-201ENST00000304062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
CPLX1-201ENST00000304062 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CPLX1-201ENST00000304062 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CPLX1-201ENST00000304062 TOPBP1Q92547 1522 aa37.06■■■■□ 3.52
CPLX1-201ENST00000304062 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.05■■■■□ 3.52
CPLX1-201ENST00000304062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CPLX1-201ENST00000304062 TOP2BQ02880 1626 aa37.02■■■■□ 3.52
CPLX1-201ENST00000304062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37■■■■□ 3.51
CPLX1-201ENST00000304062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.97■■■■□ 3.51
CPLX1-201ENST00000304062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.93■■■■□ 3.5
CPLX1-201ENST00000304062 WDR62O43379 1518 aa36.88■■■■□ 3.49
CPLX1-201ENST00000304062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
CPLX1-201ENST00000304062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.85■■■■□ 3.49
CPLX1-201ENST00000304062 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
CPLX1-201ENST00000304062 SOGA1O94964 1423 aa36.74■■■■□ 3.47
CPLX1-201ENST00000304062 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.73■■■■□ 3.47
CPLX1-201ENST00000304062 CUX2O14529 1486 aa36.73■■■■□ 3.47
CPLX1-201ENST00000304062 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
CPLX1-201ENST00000304062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CPLX1-201ENST00000304062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CPLX1-201ENST00000304062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CPLX1-201ENST00000304062 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.53■■■■□ 3.44
CPLX1-201ENST00000304062 WDR97A6NE52 1622 aa36.46■■■■□ 3.43
CPLX1-201ENST00000304062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.45■■■■□ 3.43
CPLX1-201ENST00000304062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.45■■■■□ 3.43
CPLX1-201ENST00000304062 IFT140Q96RY7 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
CPLX1-201ENST00000304062 KIF27Q86VH2 1401 aa36.32■■■■□ 3.41
CPLX1-201ENST00000304062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CPLX1-201ENST00000304062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.27■■■■□ 3.4
CPLX1-201ENST00000304062 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.26■■■■□ 3.39
CPLX1-201ENST00000304062 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.22■■■■□ 3.39
CPLX1-201ENST00000304062 IGF1RP08069 1367 aa36.19■■■■□ 3.38
CPLX1-201ENST00000304062 PBRM1Q86U86 1689 aa36.13■■■■□ 3.38
CPLX1-201ENST00000304062 EEA1Q15075 1411 aa36.08■■■■□ 3.37
CPLX1-201ENST00000304062 GRIN2BQ13224 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
CPLX1-201ENST00000304062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.02■■■■□ 3.36
CPLX1-201ENST00000304062 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.98■■■■□ 3.35
CPLX1-201ENST00000304062 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.97■■■■□ 3.35
CPLX1-201ENST00000304062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.96■■■■□ 3.35
CPLX1-201ENST00000304062 PRXQ9BXM0 1461 aa35.93■■■■□ 3.34
CPLX1-201ENST00000304062 FBLN2P98095 1184 aa35.92■■■■□ 3.34
CPLX1-201ENST00000304062 ADAMTS12P58397 1594 aa35.87■■■■□ 3.33
CPLX1-201ENST00000304062 CUL7Q14999 1698 aa35.82■■■■□ 3.33
CPLX1-201ENST00000304062 KIF21BO75037 1637 aa35.81■■■■□ 3.32
CPLX1-201ENST00000304062 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
CPLX1-201ENST00000304062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.78■■■■□ 3.32
CPLX1-201ENST00000304062 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CPLX1-201ENST00000304062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CPLX1-201ENST00000304062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
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