RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438240.5

POLR2H-204, Transcript of RNA polymerase II subunit H, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene POLR2H, Length 994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2H-204ENST00000438240 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.17■■■■■ 6.1
POLR2H-204ENST00000438240 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.35■■■■■ 5.17
POLR2H-204ENST00000438240 ABCC9O60706 1549 aa46.47■■■■■ 5.03
POLR2H-204ENST00000438240 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.65■■■■■ 4.74
POLR2H-204ENST00000438240 NACADO15069 1562 aa44.56■■■■■ 4.72
POLR2H-204ENST00000438240 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.41■■■■■ 4.7
POLR2H-204ENST00000438240 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.27■■■■■ 4.68
POLR2H-204ENST00000438240 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
POLR2H-204ENST00000438240 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.01■■■■■ 4.64
POLR2H-204ENST00000438240 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.62■■■■■ 4.57
POLR2H-204ENST00000438240 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.532e-6■■■□□ 17
POLR2H-204ENST00000438240 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.31■■■■■ 4.52
POLR2H-204ENST00000438240 SCRIBQ14160 1630 aa43.16■■■■■ 4.5
POLR2H-204ENST00000438240 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.06■■■■■ 4.48
POLR2H-204ENST00000438240 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.87■■■■■ 4.45
POLR2H-204ENST00000438240 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
POLR2H-204ENST00000438240 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.04■■■■■ 4.32
POLR2H-204ENST00000438240 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
POLR2H-204ENST00000438240 SMARCA4P51532 1647 aa41.29■■■■■ 4.2
POLR2H-204ENST00000438240 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
POLR2H-204ENST00000438240 NCAPD3P42695 1498 aa41.13■■■■■ 4.17
POLR2H-204ENST00000438240 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.12■■■■■ 4.17
POLR2H-204ENST00000438240 SMARCA2P51531 1590 aa41.05■■■■■ 4.16
POLR2H-204ENST00000438240 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.96■■■■■ 4.15
POLR2H-204ENST00000438240 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.91■■■■■ 4.14
POLR2H-204ENST00000438240 HMGXB3Q12766 1538 aa40.91■■■■■ 4.14
POLR2H-204ENST00000438240 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
POLR2H-204ENST00000438240 WIZO95785 1651 aa40.5■■■■■ 4.07
POLR2H-204ENST00000438240 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
POLR2H-204ENST00000438240 NESP48681 1621 aa40.16■■■■■ 4.02
POLR2H-204ENST00000438240 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
POLR2H-204ENST00000438240 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.06■■■■■ 4
POLR2H-204ENST00000438240 ERCC6Q03468 1493 aa40.06■■■■■ 4
POLR2H-204ENST00000438240 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.91■■■■□ 3.98
POLR2H-204ENST00000438240 CUX2O14529 1486 aa39.8■■■■□ 3.96
POLR2H-204ENST00000438240 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.79■■■■□ 3.96
POLR2H-204ENST00000438240 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.68■■■■□ 3.94
POLR2H-204ENST00000438240 CFTRP13569 1480 aa39.64■■■■□ 3.94
POLR2H-204ENST00000438240 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
POLR2H-204ENST00000438240 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.6■■■■□ 3.93
POLR2H-204ENST00000438240 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.44■■■■□ 3.9
POLR2H-204ENST00000438240 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.43■■■■□ 3.9
POLR2H-204ENST00000438240 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.41■■■■□ 3.9
POLR2H-204ENST00000438240 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.4■■■■□ 3.9
POLR2H-204ENST00000438240 PRDM2Q13029 1718 aa39.31■■■■□ 3.88
POLR2H-204ENST00000438240 WDR62O43379 1518 aa39.29■■■■□ 3.88
POLR2H-204ENST00000438240 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
POLR2H-204ENST00000438240 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
POLR2H-204ENST00000438240 TOPBP1Q92547 1522 aa38.8■■■■□ 3.8
POLR2H-204ENST00000438240 ABCC8Q09428 1581 aa38.78■■■■□ 3.8
POLR2H-204ENST00000438240 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.74■■■■□ 3.79
POLR2H-204ENST00000438240 IFT140Q96RY7 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
POLR2H-204ENST00000438240 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
POLR2H-204ENST00000438240 CUX1P39880 1505 aa38.44■■■■□ 3.74
POLR2H-204ENST00000438240 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
POLR2H-204ENST00000438240 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
POLR2H-204ENST00000438240 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.34■■■■□ 3.73
POLR2H-204ENST00000438240 SOGA1O94964 1423 aa38.29■■■■□ 3.72
POLR2H-204ENST00000438240 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.28■■■■□ 3.72
POLR2H-204ENST00000438240 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
POLR2H-204ENST00000438240 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.18■■■■□ 3.72e-7■■■■□ 24.7
POLR2H-204ENST00000438240 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
POLR2H-204ENST00000438240 WDR97A6NE52 1622 aa38.09■■■■□ 3.69
POLR2H-204ENST00000438240 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
POLR2H-204ENST00000438240 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.07■■■■□ 3.68
POLR2H-204ENST00000438240 TOP2BQ02880 1626 aa38.06■■■■□ 3.68
POLR2H-204ENST00000438240 SYNJ1O43426 1573 aa38.04■■■■□ 3.68
POLR2H-204ENST00000438240 OSCARQ8IYS5 282 aa38.03■■■■□ 3.68
POLR2H-204ENST00000438240 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.97■■■■□ 3.67
POLR2H-204ENST00000438240 GRIN2BQ13224 1484 aa37.87■■■■□ 3.65
POLR2H-204ENST00000438240 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.84■■■■□ 3.65
POLR2H-204ENST00000438240 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.84■■■■□ 3.65
POLR2H-204ENST00000438240 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.83■■■■□ 3.65
POLR2H-204ENST00000438240 CHD1O14646 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
POLR2H-204ENST00000438240 TRIM41Q8WV44 630 aa37.81■■■■□ 3.64
POLR2H-204ENST00000438240 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
POLR2H-204ENST00000438240 PBRM1Q86U86 1689 aa37.77■■■■□ 3.64
POLR2H-204ENST00000438240 FBLN2P98095 1184 aa37.72■■■■□ 3.63
POLR2H-204ENST00000438240 SYNJ2O15056 1496 aa37.64■■■■□ 3.62
POLR2H-204ENST00000438240 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
POLR2H-204ENST00000438240 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.51■■■■□ 3.6
POLR2H-204ENST00000438240 ADAMTS12P58397 1594 aa37.48■■■■□ 3.59
POLR2H-204ENST00000438240 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
POLR2H-204ENST00000438240 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
POLR2H-204ENST00000438240 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.45■■■■□ 3.59
POLR2H-204ENST00000438240 ARHGEF11O15085 1522 aa37.44■■■■□ 3.58
POLR2H-204ENST00000438240 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.44■■■■□ 3.58
POLR2H-204ENST00000438240 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
POLR2H-204ENST00000438240 GRIN2AQ12879 1464 aa37.39■■■■□ 3.58
POLR2H-204ENST00000438240 KIF27Q86VH2 1401 aa37.34■■■■□ 3.57
POLR2H-204ENST00000438240 NUP160Q12769 1436 aa37.25■■■■□ 3.55
POLR2H-204ENST00000438240 IGF1RP08069 1367 aa37.22■■■■□ 3.55
POLR2H-204ENST00000438240 CEP170Q5SW79 1584 aa37.21■■■■□ 3.55
POLR2H-204ENST00000438240 ARAP1Q96P48 1450 aa37.13■■■■□ 3.54
POLR2H-204ENST00000438240 CUL7Q14999 1698 aa37.12■■■■□ 3.53
POLR2H-204ENST00000438240 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.09■■■■□ 3.53
POLR2H-204ENST00000438240 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.99■■■■□ 3.51
POLR2H-204ENST00000438240 SHROOM2Q13796 1616 aa36.98■■■■□ 3.51
POLR2H-204ENST00000438240 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.94■■■■□ 3.5
POLR2H-204ENST00000438240 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms