RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638988.1

SLC35A3-213, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,286 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-213ENST00000638988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.84■■■■■ 6.05
SLC35A3-213ENST00000638988 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.22■■■■■ 5.15
SLC35A3-213ENST00000638988 ABCC9O60706 1549 aa46.54■■■■■ 5.04
SLC35A3-213ENST00000638988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.65■■■■■ 4.74
SLC35A3-213ENST00000638988 NACADO15069 1562 aa44.51■■■■■ 4.72
SLC35A3-213ENST00000638988 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.26■■■■■ 4.68
SLC35A3-213ENST00000638988 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.14■■■■■ 4.66
SLC35A3-213ENST00000638988 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
SLC35A3-213ENST00000638988 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.8■■■■■ 4.6
SLC35A3-213ENST00000638988 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.77■■■■■ 4.6
SLC35A3-213ENST00000638988 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
SLC35A3-213ENST00000638988 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.39■■■■■ 4.54
SLC35A3-213ENST00000638988 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.26■■■■■ 4.52
SLC35A3-213ENST00000638988 SCRIBQ14160 1630 aa42.95■■■■■ 4.47
SLC35A3-213ENST00000638988 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC35A3-213ENST00000638988 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
SLC35A3-213ENST00000638988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.1■■■■■ 4.33
SLC35A3-213ENST00000638988 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.91■■■■■ 4.3
SLC35A3-213ENST00000638988 SMARCA4P51532 1647 aa41.08■■■■■ 4.17
SLC35A3-213ENST00000638988 NCAPD3P42695 1498 aa41.07■■■■■ 4.16
SLC35A3-213ENST00000638988 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
SLC35A3-213ENST00000638988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.98■■■■■ 4.15
SLC35A3-213ENST00000638988 SMARCA2P51531 1590 aa40.95■■■■■ 4.15
SLC35A3-213ENST00000638988 HMGXB3Q12766 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
SLC35A3-213ENST00000638988 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC35A3-213ENST00000638988 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
SLC35A3-213ENST00000638988 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SLC35A3-213ENST00000638988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC35A3-213ENST00000638988 WIZO95785 1651 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC35A3-213ENST00000638988 ERCC6Q03468 1493 aa40.19■■■■■ 4.03
SLC35A3-213ENST00000638988 NESP48681 1621 aa40.12■■■■■ 4.01
SLC35A3-213ENST00000638988 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
SLC35A3-213ENST00000638988 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.06■■■■■ 4
SLC35A3-213ENST00000638988 CUX2O14529 1486 aa39.98■■■■□ 3.99
SLC35A3-213ENST00000638988 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.83■■■■□ 3.97
SLC35A3-213ENST00000638988 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.82■■■■□ 3.96
SLC35A3-213ENST00000638988 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
SLC35A3-213ENST00000638988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
SLC35A3-213ENST00000638988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.66■■■■□ 3.94
SLC35A3-213ENST00000638988 CFTRP13569 1480 aa39.49■■■■□ 3.91
SLC35A3-213ENST00000638988 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.4■■■■□ 3.9
SLC35A3-213ENST00000638988 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.37■■■■□ 3.89
SLC35A3-213ENST00000638988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC35A3-213ENST00000638988 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.3■■■■□ 3.88
SLC35A3-213ENST00000638988 WDR62O43379 1518 aa39.29■■■■□ 3.88
SLC35A3-213ENST00000638988 PRDM2Q13029 1718 aa39.17■■■■□ 3.86
SLC35A3-213ENST00000638988 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
SLC35A3-213ENST00000638988 ABCC8Q09428 1581 aa38.73■■■■□ 3.79
SLC35A3-213ENST00000638988 TOPBP1Q92547 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
SLC35A3-213ENST00000638988 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
SLC35A3-213ENST00000638988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC35A3-213ENST00000638988 TRIM41Q8WV44 630 aa38.58■■■■□ 3.77
SLC35A3-213ENST00000638988 IFT140Q96RY7 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
SLC35A3-213ENST00000638988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
SLC35A3-213ENST00000638988 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
SLC35A3-213ENST00000638988 OSCARQ8IYS5 282 aa38.31■■■■□ 3.72
SLC35A3-213ENST00000638988 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
SLC35A3-213ENST00000638988 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
SLC35A3-213ENST00000638988 CUX1P39880 1505 aa38.18■■■■□ 3.7
SLC35A3-213ENST00000638988 SOGA1O94964 1423 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC35A3-213ENST00000638988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC35A3-213ENST00000638988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC35A3-213ENST00000638988 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.09■■■■□ 3.69
SLC35A3-213ENST00000638988 WDR97A6NE52 1622 aa38.05■■■■□ 3.68
SLC35A3-213ENST00000638988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
SLC35A3-213ENST00000638988 CHD1O14646 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.81■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 GRIN2BQ13224 1484 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 TOP2BQ02880 1626 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC35A3-213ENST00000638988 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC35A3-213ENST00000638988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
SLC35A3-213ENST00000638988 FBLN2P98095 1184 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC35A3-213ENST00000638988 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC35A3-213ENST00000638988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 SYNJ1O43426 1573 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.65■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 PBRM1Q86U86 1689 aa37.64■■■■□ 3.62
SLC35A3-213ENST00000638988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
SLC35A3-213ENST00000638988 SYNJ2O15056 1496 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC35A3-213ENST00000638988 ARHGEF11O15085 1522 aa37.58■■■■□ 3.61
SLC35A3-213ENST00000638988 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.5■■■■□ 3.59
SLC35A3-213ENST00000638988 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.43■■■■□ 3.58
SLC35A3-213ENST00000638988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.35■■■■□ 3.57
SLC35A3-213ENST00000638988 ADAMTS12P58397 1594 aa37.32■■■■□ 3.56
SLC35A3-213ENST00000638988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.28■■■■□ 3.56
SLC35A3-213ENST00000638988 GRIN2AQ12879 1464 aa37.28■■■■□ 3.56
SLC35A3-213ENST00000638988 ARAP1Q96P48 1450 aa37.23■■■■□ 3.55
SLC35A3-213ENST00000638988 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
SLC35A3-213ENST00000638988 NUP160Q12769 1436 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC35A3-213ENST00000638988 CEP170Q5SW79 1584 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC35A3-213ENST00000638988 KIF27Q86VH2 1401 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC35A3-213ENST00000638988 IGF1RP08069 1367 aa36.95■■■■□ 3.51
SLC35A3-213ENST00000638988 CUL7Q14999 1698 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC35A3-213ENST00000638988 SHROOM2Q13796 1616 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC35A3-213ENST00000638988 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.8■■■■□ 3.48
SLC35A3-213ENST00000638988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.79■■■■□ 3.48
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