RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572645.5

MCRIP1-205, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MCRIP1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1-205ENST00000572645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.22■■■■■ 6.11
MCRIP1-205ENST00000572645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.27■■■■■ 5.16
MCRIP1-205ENST00000572645 ABCC9O60706 1549 aa46.4■■■■■ 5.02
MCRIP1-205ENST00000572645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.55■■■■■ 4.72
MCRIP1-205ENST00000572645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.54■■■■■ 4.72
MCRIP1-205ENST00000572645 NACADO15069 1562 aa44.48■■■■■ 4.71
MCRIP1-205ENST00000572645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
MCRIP1-205ENST00000572645 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.17■■■■■ 4.66
MCRIP1-205ENST00000572645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
MCRIP1-205ENST00000572645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.53■■■■■ 4.56
MCRIP1-205ENST00000572645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.39■■■■■ 4.542e-6■■□□□ 13.8
MCRIP1-205ENST00000572645 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.24■■■■■ 4.51
MCRIP1-205ENST00000572645 SCRIBQ14160 1630 aa43.2■■■■■ 4.51
MCRIP1-205ENST00000572645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.69■■■■■ 4.42
MCRIP1-205ENST00000572645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.69■■■■■ 4.42
MCRIP1-205ENST00000572645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
MCRIP1-205ENST00000572645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.94■■■■■ 4.3
MCRIP1-205ENST00000572645 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.67■■■■■ 4.26
MCRIP1-205ENST00000572645 SMARCA4P51532 1647 aa41.29■■■■■ 4.2
MCRIP1-205ENST00000572645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
MCRIP1-205ENST00000572645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
MCRIP1-205ENST00000572645 NCAPD3P42695 1498 aa41.07■■■■■ 4.16
MCRIP1-205ENST00000572645 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.04■■■■■ 4.16
MCRIP1-205ENST00000572645 SMARCA2P51531 1590 aa41■■■■■ 4.15
MCRIP1-205ENST00000572645 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.87■■■■■ 4.13
MCRIP1-205ENST00000572645 HMGXB3Q12766 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
MCRIP1-205ENST00000572645 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
MCRIP1-205ENST00000572645 WIZO95785 1651 aa40.58■■■■■ 4.09
MCRIP1-205ENST00000572645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
MCRIP1-205ENST00000572645 NESP48681 1621 aa40.15■■■■■ 4.02
MCRIP1-205ENST00000572645 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
MCRIP1-205ENST00000572645 ERCC6Q03468 1493 aa39.96■■■■□ 3.99
MCRIP1-205ENST00000572645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.96■■■■□ 3.99
MCRIP1-205ENST00000572645 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.88■■■■□ 3.97
MCRIP1-205ENST00000572645 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.72■■■■□ 3.95
MCRIP1-205ENST00000572645 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.69■■■■□ 3.94
MCRIP1-205ENST00000572645 CFTRP13569 1480 aa39.63■■■■□ 3.94
MCRIP1-205ENST00000572645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.62■■■■□ 3.93
MCRIP1-205ENST00000572645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
MCRIP1-205ENST00000572645 CUX2O14529 1486 aa39.53■■■■□ 3.92
MCRIP1-205ENST00000572645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
MCRIP1-205ENST00000572645 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.43■■■■□ 3.9
MCRIP1-205ENST00000572645 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.37■■■■□ 3.89
MCRIP1-205ENST00000572645 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.32■■■■□ 3.89
MCRIP1-205ENST00000572645 PRDM2Q13029 1718 aa39.24■■■■□ 3.87
MCRIP1-205ENST00000572645 WDR62O43379 1518 aa39.19■■■■□ 3.86
MCRIP1-205ENST00000572645 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
MCRIP1-205ENST00000572645 TOPBP1Q92547 1522 aa38.79■■■■□ 3.8
MCRIP1-205ENST00000572645 ABCC8Q09428 1581 aa38.73■■■■□ 3.79
MCRIP1-205ENST00000572645 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.72■■■■□ 3.79
MCRIP1-205ENST00000572645 IFT140Q96RY7 1462 aa38.54■■■■□ 3.76
MCRIP1-205ENST00000572645 CUX1P39880 1505 aa38.5■■■■□ 3.75
MCRIP1-205ENST00000572645 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
MCRIP1-205ENST00000572645 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
MCRIP1-205ENST00000572645 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.41■■■■□ 3.74
MCRIP1-205ENST00000572645 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
MCRIP1-205ENST00000572645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
MCRIP1-205ENST00000572645 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.34■■■■□ 3.73
MCRIP1-205ENST00000572645 SOGA1O94964 1423 aa38.31■■■■□ 3.72
MCRIP1-205ENST00000572645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
MCRIP1-205ENST00000572645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
MCRIP1-205ENST00000572645 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.713e-6■■■□□ 17.5
MCRIP1-205ENST00000572645 SYNJ1O43426 1573 aa38.14■■■■□ 3.7
MCRIP1-205ENST00000572645 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
MCRIP1-205ENST00000572645 TOP2BQ02880 1626 aa38.12■■■■□ 3.69
MCRIP1-205ENST00000572645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.11■■■■□ 3.69
MCRIP1-205ENST00000572645 WDR97A6NE52 1622 aa38.01■■■■□ 3.68
MCRIP1-205ENST00000572645 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.97■■■■□ 3.67
MCRIP1-205ENST00000572645 OSCARQ8IYS5 282 aa37.92■■■■□ 3.66
MCRIP1-205ENST00000572645 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.86■■■■□ 3.65
MCRIP1-205ENST00000572645 GRIN2BQ13224 1484 aa37.84■■■■□ 3.65
MCRIP1-205ENST00000572645 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.83■■■■□ 3.65
MCRIP1-205ENST00000572645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.82■■■■□ 3.64
MCRIP1-205ENST00000572645 FBLN2P98095 1184 aa37.76■■■■□ 3.64
MCRIP1-205ENST00000572645 PBRM1Q86U86 1689 aa37.74■■■■□ 3.63
MCRIP1-205ENST00000572645 CHD1O14646 1710 aa37.73■■■■□ 3.63
MCRIP1-205ENST00000572645 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
MCRIP1-205ENST00000572645 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
MCRIP1-205ENST00000572645 SYNJ2O15056 1496 aa37.61■■■■□ 3.61
MCRIP1-205ENST00000572645 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.51■■■■□ 3.59
MCRIP1-205ENST00000572645 ADAMTS12P58397 1594 aa37.47■■■■□ 3.59
MCRIP1-205ENST00000572645 KIF27Q86VH2 1401 aa37.42■■■■□ 3.58
MCRIP1-205ENST00000572645 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
MCRIP1-205ENST00000572645 GRIN2AQ12879 1464 aa37.37■■■■□ 3.57
MCRIP1-205ENST00000572645 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.35■■■■□ 3.57
MCRIP1-205ENST00000572645 IGF1RP08069 1367 aa37.31■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 TRIM41Q8WV44 630 aa37.31■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.31■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 ARHGEF11O15085 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
MCRIP1-205ENST00000572645 NUP160Q12769 1436 aa37.2■■■■□ 3.55
MCRIP1-205ENST00000572645 CEP170Q5SW79 1584 aa37.2■■■■□ 3.55
MCRIP1-205ENST00000572645 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.14■■■■□ 3.54
MCRIP1-205ENST00000572645 CUL7Q14999 1698 aa37.13■■■■□ 3.53
MCRIP1-205ENST00000572645 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.07■■■■□ 3.53
MCRIP1-205ENST00000572645 ARAP1Q96P48 1450 aa37.01■■■■□ 3.52
MCRIP1-205ENST00000572645 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37■■■■□ 3.51
MCRIP1-205ENST00000572645 SHROOM2Q13796 1616 aa36.9■■■■□ 3.5
MCRIP1-205ENST00000572645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms