RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535504.1

SSPN-204, Transcript of sarcospan, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SSPN, Length 419 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPN-204ENST00000535504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.64■■■■■ 6.02
SSPN-204ENST00000535504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.86■■■■■ 5.09
SSPN-204ENST00000535504 ABCC9O60706 1549 aa45.79■■■■■ 4.92
SSPN-204ENST00000535504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.17■■■■■ 4.66
SSPN-204ENST00000535504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.14■■■■■ 4.66
SSPN-204ENST00000535504 NACADO15069 1562 aa44.07■■■■■ 4.65
SSPN-204ENST00000535504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
SSPN-204ENST00000535504 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.77■■■■■ 4.6
SSPN-204ENST00000535504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.58■■■■■ 4.57
SSPN-204ENST00000535504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.97■■■■■ 4.47
SSPN-204ENST00000535504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.44
SSPN-204ENST00000535504 SCRIBQ14160 1630 aa42.74■■■■■ 4.43
SSPN-204ENST00000535504 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.59■■■■■ 4.41
SSPN-204ENST00000535504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.36■■■■■ 4.37
SSPN-204ENST00000535504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.82■■■■■ 4.29
SSPN-204ENST00000535504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
SSPN-204ENST00000535504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.41■■■■■ 4.22
SSPN-204ENST00000535504 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.18■■■■■ 4.18
SSPN-204ENST00000535504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
SSPN-204ENST00000535504 SMARCA4P51532 1647 aa40.86■■■■■ 4.13
SSPN-204ENST00000535504 SMARCA2P51531 1590 aa40.68■■■■■ 4.1
SSPN-204ENST00000535504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.62■■■■■ 4.09
SSPN-204ENST00000535504 NCAPD3P42695 1498 aa40.59■■■■■ 4.09
SSPN-204ENST00000535504 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.52■■■■■ 4.08
SSPN-204ENST00000535504 HMGXB3Q12766 1538 aa40.44■■■■■ 4.06
SSPN-204ENST00000535504 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
SSPN-204ENST00000535504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
SSPN-204ENST00000535504 WIZO95785 1651 aa40.11■■■■■ 4.01
SSPN-204ENST00000535504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
SSPN-204ENST00000535504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
SSPN-204ENST00000535504 ERCC6Q03468 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
SSPN-204ENST00000535504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.59■■■■□ 3.93
SSPN-204ENST00000535504 NESP48681 1621 aa39.55■■■■□ 3.92
SSPN-204ENST00000535504 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.46■■■■□ 3.91
SSPN-204ENST00000535504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.4■■■■□ 3.9
SSPN-204ENST00000535504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
SSPN-204ENST00000535504 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.24■■■■□ 3.87
SSPN-204ENST00000535504 CFTRP13569 1480 aa39.19■■■■□ 3.86
SSPN-204ENST00000535504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.14■■■■□ 3.86
SSPN-204ENST00000535504 CUX2O14529 1486 aa39.12■■■■□ 3.85
SSPN-204ENST00000535504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.02■■■■□ 3.84
SSPN-204ENST00000535504 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.02■■■■□ 3.84
SSPN-204ENST00000535504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
SSPN-204ENST00000535504 PRDM2Q13029 1718 aa38.95■■■■□ 3.83
SSPN-204ENST00000535504 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.92■■■■□ 3.82
SSPN-204ENST00000535504 WDR62O43379 1518 aa38.74■■■■□ 3.79
SSPN-204ENST00000535504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
SSPN-204ENST00000535504 ABCC8Q09428 1581 aa38.49■■■■□ 3.75
SSPN-204ENST00000535504 TOPBP1Q92547 1522 aa38.37■■■■□ 3.73
SSPN-204ENST00000535504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.36■■■■□ 3.73
SSPN-204ENST00000535504 IFT140Q96RY7 1462 aa38.19■■■■□ 3.7
SSPN-204ENST00000535504 CUX1P39880 1505 aa38.03■■■■□ 3.68
SSPN-204ENST00000535504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
SSPN-204ENST00000535504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.96■■■■□ 3.67
SSPN-204ENST00000535504 SOGA1O94964 1423 aa37.94■■■■□ 3.66
SSPN-204ENST00000535504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
SSPN-204ENST00000535504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
SSPN-204ENST00000535504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
SSPN-204ENST00000535504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.84■■■■□ 3.65
SSPN-204ENST00000535504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.81■■■■□ 3.64
SSPN-204ENST00000535504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
SSPN-204ENST00000535504 TOP2BQ02880 1626 aa37.77■■■■□ 3.64
SSPN-204ENST00000535504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.76■■■■□ 3.63
SSPN-204ENST00000535504 WDR97A6NE52 1622 aa37.74■■■■□ 3.63
SSPN-204ENST00000535504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.71■■■■□ 3.63
SSPN-204ENST00000535504 SYNJ1O43426 1573 aa37.7■■■■□ 3.63
SSPN-204ENST00000535504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SSPN-204ENST00000535504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.6■■■■□ 3.61
SSPN-204ENST00000535504 OSCARQ8IYS5 282 aa37.55■■■■□ 3.6
SSPN-204ENST00000535504 GRIN2BQ13224 1484 aa37.51■■■■□ 3.59
SSPN-204ENST00000535504 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.51■■■■□ 3.59
SSPN-204ENST00000535504 FBLN2P98095 1184 aa37.44■■■■□ 3.58
SSPN-204ENST00000535504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.41■■■■□ 3.58
SSPN-204ENST00000535504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
SSPN-204ENST00000535504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.41■■■■□ 3.58
SSPN-204ENST00000535504 PBRM1Q86U86 1689 aa37.4■■■■□ 3.58
SSPN-204ENST00000535504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SSPN-204ENST00000535504 CHD1O14646 1710 aa37.32■■■■□ 3.56
SSPN-204ENST00000535504 SYNJ2O15056 1496 aa37.24■■■■□ 3.55
SSPN-204ENST00000535504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.19■■■■□ 3.54
SSPN-204ENST00000535504 KIF27Q86VH2 1401 aa37.17■■■■□ 3.54
SSPN-204ENST00000535504 TRIM41Q8WV44 630 aa37.12■■■■□ 3.53
SSPN-204ENST00000535504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.09■■■■□ 3.53
SSPN-204ENST00000535504 ADAMTS12P58397 1594 aa37.08■■■■□ 3.53
SSPN-204ENST00000535504 GRIN2AQ12879 1464 aa36.99■■■■□ 3.51
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SSPN-204ENST00000535504 IGF1RP08069 1367 aa36.87■■■■□ 3.49
SSPN-204ENST00000535504 ARHGEF11O15085 1522 aa36.84■■■■□ 3.49
SSPN-204ENST00000535504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
SSPN-204ENST00000535504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
SSPN-204ENST00000535504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.82■■■■□ 3.49
SSPN-204ENST00000535504 NUP160Q12769 1436 aa36.78■■■■□ 3.48
SSPN-204ENST00000535504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.75■■■■□ 3.47
SSPN-204ENST00000535504 CEP170Q5SW79 1584 aa36.74■■■■□ 3.47
SSPN-204ENST00000535504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.61■■■■□ 3.45
SSPN-204ENST00000535504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.56■■■■□ 3.44
SSPN-204ENST00000535504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.55■■■■□ 3.44
SSPN-204ENST00000535504 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.52■■■■□ 3.44
SSPN-204ENST00000535504 EEA1Q15075 1411 aa36.51■■■■□ 3.43
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