RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396997.1

NRL-202, Transcript of neural retina leucine zipper, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRL, Length 1,517 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRL-202ENST00000396997 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.27■■■■■ 6.12
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NRL-202ENST00000396997 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
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NRL-202ENST00000396997 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.06■■■■■ 4.64
NRL-202ENST00000396997 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.94■■■■■ 4.62
NRL-202ENST00000396997 NACADO15069 1562 aa43.8■■■■■ 4.6
NRL-202ENST00000396997 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.57■■■■■ 4.57
NRL-202ENST00000396997 SCRIBQ14160 1630 aa42.83■■■■■ 4.45
NRL-202ENST00000396997 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.77■■■■■ 4.44
NRL-202ENST00000396997 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.54■■■■■ 4.4
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NRL-202ENST00000396997 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.33■■■■■ 4.21
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NRL-202ENST00000396997 SMARCA4P51532 1647 aa41.09■■■■■ 4.17
NRL-202ENST00000396997 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.06■■■■■ 4.16
NRL-202ENST00000396997 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
NRL-202ENST00000396997 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
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NRL-202ENST00000396997 WIZO95785 1651 aa40.67■■■■■ 4.1
NRL-202ENST00000396997 SMARCA2P51531 1590 aa40.62■■■■■ 4.09
NRL-202ENST00000396997 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.57■■■■■ 4.09
NRL-202ENST00000396997 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.51■■■■■ 4.08
NRL-202ENST00000396997 NCAPD3P42695 1498 aa40.39■■■■■ 4.06
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NRL-202ENST00000396997 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
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NRL-202ENST00000396997 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.28■■■■□ 3.88
NRL-202ENST00000396997 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
NRL-202ENST00000396997 PRDM2Q13029 1718 aa39.09■■■■□ 3.85
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NRL-202ENST00000396997 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.87■■■■□ 3.81
NRL-202ENST00000396997 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.82■■■■□ 3.81
NRL-202ENST00000396997 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.81■■■■□ 3.8
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NRL-202ENST00000396997 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.69■■■■□ 3.78
NRL-202ENST00000396997 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
NRL-202ENST00000396997 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.62■■■■□ 3.77
NRL-202ENST00000396997 TRIM41Q8WV44 630 aa38.58■■■■□ 3.77
NRL-202ENST00000396997 ERCC6Q03468 1493 aa38.51■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 SYNJ1O43426 1573 aa38.48■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 TOP2BQ02880 1626 aa38.45■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 CUX1P39880 1505 aa38.45■■■■□ 3.74
NRL-202ENST00000396997 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.43■■■■□ 3.74
NRL-202ENST00000396997 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.4■■■■□ 3.74
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NRL-202ENST00000396997 TOPBP1Q92547 1522 aa38.33■■■■□ 3.73
NRL-202ENST00000396997 WDR62O43379 1518 aa38.2■■■■□ 3.71
NRL-202ENST00000396997 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
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NRL-202ENST00000396997 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.86■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 CUX2O14529 1486 aa37.86■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 IFT140Q96RY7 1462 aa37.83■■■■□ 3.65
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NRL-202ENST00000396997 KIF27Q86VH2 1401 aa37.8■■■■□ 3.64
NRL-202ENST00000396997 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
NRL-202ENST00000396997 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.72■■■■□ 3.63
NRL-202ENST00000396997 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
NRL-202ENST00000396997 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.61■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.59■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.54■■■■□ 3.6
NRL-202ENST00000396997 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
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NRL-202ENST00000396997 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.1■■■■□ 3.53
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NRL-202ENST00000396997 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
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NRL-202ENST00000396997 CHD1O14646 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
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