RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396997.1

NRL-202, Transcript of neural retina leucine zipper, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRL, Length 1,517 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRL-202ENST00000396997 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.27■■■■■ 6.12
NRL-202ENST00000396997 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.87■■■■■ 5.09
NRL-202ENST00000396997 ABCC9O60706 1549 aa44.72■■■■■ 4.75
NRL-202ENST00000396997 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
NRL-202ENST00000396997 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.16■■■■■ 4.66
NRL-202ENST00000396997 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.06■■■■■ 4.64
NRL-202ENST00000396997 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.94■■■■■ 4.62
NRL-202ENST00000396997 NACADO15069 1562 aa43.8■■■■■ 4.6
NRL-202ENST00000396997 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.57■■■■■ 4.57
NRL-202ENST00000396997 SCRIBQ14160 1630 aa42.83■■■■■ 4.45
NRL-202ENST00000396997 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.77■■■■■ 4.44
NRL-202ENST00000396997 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.54■■■■■ 4.4
NRL-202ENST00000396997 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.15■■■■■ 4.34
NRL-202ENST00000396997 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.31
NRL-202ENST00000396997 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.33■■■■■ 4.21
NRL-202ENST00000396997 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
NRL-202ENST00000396997 SMARCA4P51532 1647 aa41.09■■■■■ 4.17
NRL-202ENST00000396997 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.06■■■■■ 4.16
NRL-202ENST00000396997 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
NRL-202ENST00000396997 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
NRL-202ENST00000396997 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
NRL-202ENST00000396997 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.69■■■■■ 4.1
NRL-202ENST00000396997 WIZO95785 1651 aa40.67■■■■■ 4.1
NRL-202ENST00000396997 SMARCA2P51531 1590 aa40.62■■■■■ 4.09
NRL-202ENST00000396997 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.57■■■■■ 4.09
NRL-202ENST00000396997 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.51■■■■■ 4.08
NRL-202ENST00000396997 NCAPD3P42695 1498 aa40.39■■■■■ 4.06
NRL-202ENST00000396997 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
NRL-202ENST00000396997 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
NRL-202ENST00000396997 HMGXB3Q12766 1538 aa40.31■■■■■ 4.04
NRL-202ENST00000396997 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.95■■■■□ 3.99
NRL-202ENST00000396997 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.84■■■■□ 3.97
NRL-202ENST00000396997 CFTRP13569 1480 aa39.29■■■■□ 3.88
NRL-202ENST00000396997 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.28■■■■□ 3.88
NRL-202ENST00000396997 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
NRL-202ENST00000396997 PRDM2Q13029 1718 aa39.09■■■■□ 3.85
NRL-202ENST00000396997 NESP48681 1621 aa39.02■■■■□ 3.84
NRL-202ENST00000396997 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.87■■■■□ 3.81
NRL-202ENST00000396997 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.82■■■■□ 3.81
NRL-202ENST00000396997 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.81■■■■□ 3.8
NRL-202ENST00000396997 ABCC8Q09428 1581 aa38.73■■■■□ 3.79
NRL-202ENST00000396997 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.69■■■■□ 3.78
NRL-202ENST00000396997 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
NRL-202ENST00000396997 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.62■■■■□ 3.77
NRL-202ENST00000396997 TRIM41Q8WV44 630 aa38.58■■■■□ 3.77
NRL-202ENST00000396997 ERCC6Q03468 1493 aa38.51■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 SYNJ1O43426 1573 aa38.48■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 TOP2BQ02880 1626 aa38.45■■■■□ 3.75
NRL-202ENST00000396997 CUX1P39880 1505 aa38.45■■■■□ 3.74
NRL-202ENST00000396997 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.43■■■■□ 3.74
NRL-202ENST00000396997 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.4■■■■□ 3.74
NRL-202ENST00000396997 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.38■■■■□ 3.73
NRL-202ENST00000396997 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
NRL-202ENST00000396997 TOPBP1Q92547 1522 aa38.33■■■■□ 3.73
NRL-202ENST00000396997 WDR62O43379 1518 aa38.2■■■■□ 3.71
NRL-202ENST00000396997 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
NRL-202ENST00000396997 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.16■■■■□ 3.7
NRL-202ENST00000396997 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
NRL-202ENST00000396997 SOGA1O94964 1423 aa37.96■■■■□ 3.67
NRL-202ENST00000396997 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.88■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 EEA1Q15075 1411 aa37.87■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.86■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 CUX2O14529 1486 aa37.86■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 IFT140Q96RY7 1462 aa37.83■■■■□ 3.65
NRL-202ENST00000396997 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
NRL-202ENST00000396997 KIF27Q86VH2 1401 aa37.8■■■■□ 3.64
NRL-202ENST00000396997 WDR97A6NE52 1622 aa37.77■■■■□ 3.64
NRL-202ENST00000396997 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.72■■■■□ 3.63
NRL-202ENST00000396997 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
NRL-202ENST00000396997 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.61■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.59■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
NRL-202ENST00000396997 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.54■■■■□ 3.6
NRL-202ENST00000396997 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
NRL-202ENST00000396997 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.59
NRL-202ENST00000396997 IGF1RP08069 1367 aa37.45■■■■□ 3.59
NRL-202ENST00000396997 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.45■■■■□ 3.58
NRL-202ENST00000396997 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
NRL-202ENST00000396997 GRIN2BQ13224 1484 aa37.39■■■■□ 3.58
NRL-202ENST00000396997 PBRM1Q86U86 1689 aa37.38■■■■□ 3.57
NRL-202ENST00000396997 KIF21BO75037 1637 aa37.34■■■■□ 3.57
NRL-202ENST00000396997 PRXQ9BXM0 1461 aa37.33■■■■□ 3.57
NRL-202ENST00000396997 CUL7Q14999 1698 aa37.33■■■■□ 3.57
NRL-202ENST00000396997 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
NRL-202ENST00000396997 GOLGA3Q08378 1498 aa37.23■■■■□ 3.55
NRL-202ENST00000396997 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.2■■■■□ 3.55
NRL-202ENST00000396997 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.2■■■■□ 3.55
NRL-202ENST00000396997 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
NRL-202ENST00000396997 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.16■■■■□ 3.54
NRL-202ENST00000396997 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.15■■■■□ 3.54
NRL-202ENST00000396997 ADAMTS12P58397 1594 aa37.14■■■■□ 3.54
NRL-202ENST00000396997 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.1■■■■□ 3.53
NRL-202ENST00000396997 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
NRL-202ENST00000396997 SYNJ2O15056 1496 aa37.01■■■■□ 3.52
NRL-202ENST00000396997 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.98■■■■□ 3.51
NRL-202ENST00000396997 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
NRL-202ENST00000396997 GRIN2AQ12879 1464 aa36.9■■■■□ 3.5
NRL-202ENST00000396997 FBLN2P98095 1184 aa36.81■■■■□ 3.48
NRL-202ENST00000396997 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
NRL-202ENST00000396997 CHD1O14646 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms