RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.58■■■■■ 5.85
PMS1-205ENST00000409985 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.36■■■■■ 4.85
PMS1-205ENST00000409985 ABCC9O60706 1549 aa43.77■■■■■ 4.6
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
PMS1-205ENST00000409985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.79■■■■■ 4.44
PMS1-205ENST00000409985 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.62■■■■■ 4.41
PMS1-205ENST00000409985 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.46■■■■■ 4.39
PMS1-205ENST00000409985 NACADO15069 1562 aa42.45■■■■■ 4.39
PMS1-205ENST00000409985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.3■■■■■ 4.36
PMS1-205ENST00000409985 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.89■■■■■ 4.3
PMS1-205ENST00000409985 SCRIBQ14160 1630 aa41.62■■■■■ 4.25
PMS1-205ENST00000409985 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.54■■■■■ 4.24
PMS1-205ENST00000409985 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.19■■■■■ 4.18
PMS1-205ENST00000409985 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
PMS1-205ENST00000409985 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
PMS1-205ENST00000409985 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.22■■■■■ 4.03
PMS1-205ENST00000409985 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.13■■■■■ 4.01
PMS1-205ENST00000409985 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PMS1-205ENST00000409985 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.85■■■■□ 3.97
PMS1-205ENST00000409985 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
PMS1-205ENST00000409985 SMARCA4P51532 1647 aa39.84■■■■□ 3.97
PMS1-205ENST00000409985 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
PMS1-205ENST00000409985 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.6■■■■□ 3.93
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.58■■■■□ 3.93
PMS1-205ENST00000409985 WIZO95785 1651 aa39.46■■■■□ 3.91
PMS1-205ENST00000409985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.43■■■■□ 3.9
PMS1-205ENST00000409985 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.41■■■■□ 3.9
PMS1-205ENST00000409985 SMARCA2P51531 1590 aa39.3■■■■□ 3.88
PMS1-205ENST00000409985 NCAPD3P42695 1498 aa39.24■■■■□ 3.87
PMS1-205ENST00000409985 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
PMS1-205ENST00000409985 HMGXB3Q12766 1538 aa39.08■■■■□ 3.85
PMS1-205ENST00000409985 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
PMS1-205ENST00000409985 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.6■■■■□ 3.77
PMS1-205ENST00000409985 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.58■■■■□ 3.77
PMS1-205ENST00000409985 TRIM41Q8WV44 630 aa38.55■■■■□ 3.76
PMS1-205ENST00000409985 HRCP23327 699 aa38.48■■■■□ 3.75
PMS1-205ENST00000409985 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.33■■■■□ 3.73
PMS1-205ENST00000409985 NESP48681 1621 aa38.2■■■■□ 3.71
PMS1-205ENST00000409985 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.14■■■■□ 3.7
PMS1-205ENST00000409985 CFTRP13569 1480 aa38.11■■■■□ 3.69
PMS1-205ENST00000409985 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
PMS1-205ENST00000409985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.01■■■■□ 3.68
PMS1-205ENST00000409985 PRDM2Q13029 1718 aa37.81■■■■□ 3.64
PMS1-205ENST00000409985 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
PMS1-205ENST00000409985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.72■■■■□ 3.63
PMS1-205ENST00000409985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.7■■■■□ 3.63
PMS1-205ENST00000409985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.69■■■■□ 3.62
PMS1-205ENST00000409985 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.54■■■■□ 3.6
PMS1-205ENST00000409985 ABCC8Q09428 1581 aa37.53■■■■□ 3.6
PMS1-205ENST00000409985 ERCC6Q03468 1493 aa37.52■■■■□ 3.6
PMS1-205ENST00000409985 EEA1Q15075 1411 aa37.48■■■■□ 3.59
PMS1-205ENST00000409985 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
PMS1-205ENST00000409985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
PMS1-205ENST00000409985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
PMS1-205ENST00000409985 CUX1P39880 1505 aa37.32■■■■□ 3.56
PMS1-205ENST00000409985 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.31■■■■□ 3.56
PMS1-205ENST00000409985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.56
PMS1-205ENST00000409985 SYNJ1O43426 1573 aa37.27■■■■□ 3.56
PMS1-205ENST00000409985 TOPBP1Q92547 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
PMS1-205ENST00000409985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.2■■■■□ 3.55
PMS1-205ENST00000409985 WDR62O43379 1518 aa37.2■■■■□ 3.55
PMS1-205ENST00000409985 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
PMS1-205ENST00000409985 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.16■■■■□ 3.54
PMS1-205ENST00000409985 SOGA1O94964 1423 aa37.15■■■■□ 3.54
PMS1-205ENST00000409985 TOP2BQ02880 1626 aa37.14■■■■□ 3.54
PMS1-205ENST00000409985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.12■■■■□ 3.53
PMS1-205ENST00000409985 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.11■■■■□ 3.53
PMS1-205ENST00000409985 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.08■■■■□ 3.53
PMS1-205ENST00000409985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.01■■■■□ 3.52
PMS1-205ENST00000409985 CEP162Q5TB80 1403 aa37■■■■□ 3.51
PMS1-205ENST00000409985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA3Q08378 1498 aa36.96■■■■□ 3.51
PMS1-205ENST00000409985 CUX2O14529 1486 aa36.94■■■■□ 3.5
PMS1-205ENST00000409985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.91■■■■□ 3.5
PMS1-205ENST00000409985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.88■■■■□ 3.49
PMS1-205ENST00000409985 KIF21BO75037 1637 aa36.87■■■■□ 3.49
PMS1-205ENST00000409985 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
PMS1-205ENST00000409985 IFT140Q96RY7 1462 aa36.7■■■■□ 3.46
PMS1-205ENST00000409985 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
PMS1-205ENST00000409985 WDR97A6NE52 1622 aa36.66■■■■□ 3.46
PMS1-205ENST00000409985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.65■■■■□ 3.46
PMS1-205ENST00000409985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
PMS1-205ENST00000409985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PMS1-205ENST00000409985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.52■■■■□ 3.44
PMS1-205ENST00000409985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.46■■■■□ 3.43
PMS1-205ENST00000409985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
PMS1-205ENST00000409985 KIF27Q86VH2 1401 aa36.4■■■■□ 3.42
PMS1-205ENST00000409985 CLIP1P30622 1438 aa36.4■■■■□ 3.42
PMS1-205ENST00000409985 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.39■■■■□ 3.42
PMS1-205ENST00000409985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.37■■■■□ 3.41
PMS1-205ENST00000409985 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.33■■■■□ 3.41
PMS1-205ENST00000409985 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.31■■■■□ 3.4
PMS1-205ENST00000409985 IGF1RP08069 1367 aa36.28■■■■□ 3.4
PMS1-205ENST00000409985 PRXQ9BXM0 1461 aa36.27■■■■□ 3.4
PMS1-205ENST00000409985 PBRM1Q86U86 1689 aa36.26■■■■□ 3.39
PMS1-205ENST00000409985 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
PMS1-205ENST00000409985 GRIN2BQ13224 1484 aa36.23■■■■□ 3.39
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.38
PMS1-205ENST00000409985 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.14■■■■□ 3.38
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS12P58397 1594 aa36.03■■■■□ 3.36
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