Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPACA6W5XKT8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPACA6W5XKT8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPACA6W5XKT8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPACA6W5XKT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPACA6W5XKT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPACA6W5XKT8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPACA6W5XKT8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPACA6W5XKT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPACA6W5XKT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPACA6W5XKT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPACA6W5XKT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPACA6W5XKT8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPACA6W5XKT8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPACA6W5XKT8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPACA6W5XKT8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPACA6W5XKT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPACA6W5XKT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPACA6W5XKT8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPACA6W5XKT8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPACA6W5XKT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPACA6W5XKT8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPACA6W5XKT8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms