Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KL1Q9Y6S9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KL1Q9Y6S9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KL1Q9Y6S9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KL1Q9Y6S9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KL1Q9Y6S9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KL1Q9Y6S9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KL1Q9Y6S9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KL1Q9Y6S9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPS6KL1Q9Y6S9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms