Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP4R1LQ9P1A2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP4R1LQ9P1A2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP4R1LQ9P1A2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R1LQ9P1A2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP4R1LQ9P1A2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP4R1LQ9P1A2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP4R1LQ9P1A2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP4R1LQ9P1A2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP4R1LQ9P1A2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP4R1LQ9P1A2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R1LQ9P1A2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R1LQ9P1A2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms