Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRB1Q9NZV6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MSRB1Q9NZV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MSRB1Q9NZV6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSRB1Q9NZV6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSRB1Q9NZV6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MSRB1Q9NZV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRB1Q9NZV6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MSRB1Q9NZV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms