Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNIP1Q9NZI2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP1Q9NZI2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP1Q9NZI2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNIP1Q9NZI2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNIP1Q9NZI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNIP1Q9NZI2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNIP1Q9NZI2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNIP1Q9NZI2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNIP1Q9NZI2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNIP1Q9NZI2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNIP1Q9NZI2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNIP1Q9NZI2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms