Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6AQ9NYA3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA6AQ9NYA3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6AQ9NYA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6AQ9NYA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA6AQ9NYA3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6AQ9NYA3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6AQ9NYA3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6AQ9NYA3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6AQ9NYA3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6AQ9NYA3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms