Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC28Q9NX36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC28Q9NX36 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJC28Q9NX36 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC28Q9NX36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNAJC28Q9NX36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNAJC28Q9NX36 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNAJC28Q9NX36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNAJC28Q9NX36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJC28Q9NX36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNAJC28Q9NX36 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DNAJC28Q9NX36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNAJC28Q9NX36 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNAJC28Q9NX36 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNAJC28Q9NX36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNAJC28Q9NX36 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAJC28Q9NX36 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms