Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL31Q9H511 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL31Q9H511 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL31Q9H511 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL31Q9H511 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL31Q9H511 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL31Q9H511 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL31Q9H511 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL31Q9H511 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL31Q9H511 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL31Q9H511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL31Q9H511 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL31Q9H511 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL31Q9H511 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL31Q9H511 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL31Q9H511 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL31Q9H511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL31Q9H511 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms