Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMS4Q9H426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIMS4Q9H426 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIMS4Q9H426 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMS4Q9H426 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMS4Q9H426 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMS4Q9H426 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS4Q9H426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMS4Q9H426 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS4Q9H426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS4Q9H426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS4Q9H426 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS4Q9H426 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS4Q9H426 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms