Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MAP1LC3CQ9BXW4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MAP1LC3CQ9BXW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MAP1LC3CQ9BXW4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms