Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYT11Q9BT88 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYT11Q9BT88 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT11Q9BT88 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYT11Q9BT88 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYT11Q9BT88 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYT11Q9BT88 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYT11Q9BT88 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYT11Q9BT88 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYT11Q9BT88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYT11Q9BT88 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYT11Q9BT88 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYT11Q9BT88 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT11Q9BT88 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYT11Q9BT88 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT11Q9BT88 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms