Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYT11Q9BT88 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYT11Q9BT88 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SYT11Q9BT88 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYT11Q9BT88 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYT11Q9BT88 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYT11Q9BT88 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYT11Q9BT88 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SYT11Q9BT88 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYT11Q9BT88 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYT11Q9BT88 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYT11Q9BT88 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYT11Q9BT88 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYT11Q9BT88 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYT11Q9BT88 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYT11Q9BT88 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SYT11Q9BT88 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYT11Q9BT88 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYT11Q9BT88 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYT11Q9BT88 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYT11Q9BT88 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYT11Q9BT88 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYT11Q9BT88 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYT11Q9BT88 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYT11Q9BT88 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYT11Q9BT88 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYT11Q9BT88 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYT11Q9BT88 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYT11Q9BT88 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYT11Q9BT88 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYT11Q9BT88 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SYT11Q9BT88 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYT11Q9BT88 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYT11Q9BT88 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYT11Q9BT88 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYT11Q9BT88 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYT11Q9BT88 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT11Q9BT88 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYT11Q9BT88 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYT11Q9BT88 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYT11Q9BT88 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYT11Q9BT88 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYT11Q9BT88 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYT11Q9BT88 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYT11Q9BT88 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYT11Q9BT88 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYT11Q9BT88 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYT11Q9BT88 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYT11Q9BT88 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYT11Q9BT88 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYT11Q9BT88 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYT11Q9BT88 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYT11Q9BT88 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SYT11Q9BT88 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYT11Q9BT88 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYT11Q9BT88 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYT11Q9BT88 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYT11Q9BT88 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYT11Q9BT88 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYT11Q9BT88 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYT11Q9BT88 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYT11Q9BT88 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYT11Q9BT88 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYT11Q9BT88 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYT11Q9BT88 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYT11Q9BT88 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYT11Q9BT88 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYT11Q9BT88 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYT11Q9BT88 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYT11Q9BT88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYT11Q9BT88 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYT11Q9BT88 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYT11Q9BT88 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYT11Q9BT88 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYT11Q9BT88 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYT11Q9BT88 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYT11Q9BT88 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYT11Q9BT88 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SYT11Q9BT88 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYT11Q9BT88 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYT11Q9BT88 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYT11Q9BT88 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYT11Q9BT88 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYT11Q9BT88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYT11Q9BT88 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYT11Q9BT88 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT11Q9BT88 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT11Q9BT88 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYT11Q9BT88 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYT11Q9BT88 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms