Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCM2Q9BSQ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCM2Q9BSQ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCM2Q9BSQ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCM2Q9BSQ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCM2Q9BSQ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCM2Q9BSQ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCM2Q9BSQ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCM2Q9BSQ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCM2Q9BSQ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCM2Q9BSQ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCM2Q9BSQ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCM2Q9BSQ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCM2Q9BSQ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCM2Q9BSQ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCM2Q9BSQ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCM2Q9BSQ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms