Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCGF1Q9BSM1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCGF1Q9BSM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF1Q9BSM1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF1Q9BSM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCGF1Q9BSM1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCGF1Q9BSM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCGF1Q9BSM1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF1Q9BSM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms