Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPATA25Q9BR10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPATA25Q9BR10 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPATA25Q9BR10 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPATA25Q9BR10 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPATA25Q9BR10 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPATA25Q9BR10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPATA25Q9BR10 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPATA25Q9BR10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPATA25Q9BR10 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPATA25Q9BR10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPATA25Q9BR10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPATA25Q9BR10 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms