Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA25Q9BR10 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA25Q9BR10 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA25Q9BR10 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA25Q9BR10 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA25Q9BR10 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA25Q9BR10 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA25Q9BR10 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA25Q9BR10 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA25Q9BR10 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA25Q9BR10 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA25Q9BR10 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA25Q9BR10 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA25Q9BR10 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA25Q9BR10 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA25Q9BR10 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA25Q9BR10 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA25Q9BR10 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA25Q9BR10 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA25Q9BR10 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA25Q9BR10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA25Q9BR10 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA25Q9BR10 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA25Q9BR10 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA25Q9BR10 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA25Q9BR10 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA25Q9BR10 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA25Q9BR10 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA25Q9BR10 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA25Q9BR10 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA25Q9BR10 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA25Q9BR10 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA25Q9BR10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA25Q9BR10 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA25Q9BR10 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms