Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40CQ96S21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40CQ96S21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40CQ96S21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40CQ96S21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB40CQ96S21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB40CQ96S21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40CQ96S21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40CQ96S21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40CQ96S21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms