Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23CQ96ET8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23CQ96ET8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TVP23CQ96ET8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TVP23CQ96ET8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TVP23CQ96ET8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TVP23CQ96ET8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TVP23CQ96ET8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23CQ96ET8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23CQ96ET8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TVP23CQ96ET8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TVP23CQ96ET8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TVP23CQ96ET8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms