Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RMI2Q96E14 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RMI2Q96E14 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RMI2Q96E14 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RMI2Q96E14 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RMI2Q96E14 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RMI2Q96E14 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RMI2Q96E14 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RMI2Q96E14 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms