Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP205Q92621 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP205Q92621 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP205Q92621 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP205Q92621 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP205Q92621 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUP205Q92621 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUP205Q92621 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP205Q92621 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP205Q92621 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUP205Q92621 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP205Q92621 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP205Q92621 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms