Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPDL3AQ92484 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPDL3AQ92484 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPDL3AQ92484 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPDL3AQ92484 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPDL3AQ92484 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMPDL3AQ92484 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPDL3AQ92484 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMPDL3AQ92484 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPDL3AQ92484 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPDL3AQ92484 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPDL3AQ92484 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPDL3AQ92484 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPDL3AQ92484 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPDL3AQ92484 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMPDL3AQ92484 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMPDL3AQ92484 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMPDL3AQ92484 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms