Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3BQ8TF42 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBASH3BQ8TF42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3BQ8TF42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3BQ8TF42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UBASH3BQ8TF42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3BQ8TF42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBASH3BQ8TF42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.6 ms