Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
UBASH3BQ8TF42 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBASH3BQ8TF42 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBASH3BQ8TF42 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBASH3BQ8TF42 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBASH3BQ8TF42 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBASH3BQ8TF42 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBASH3BQ8TF42 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBASH3BQ8TF42 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UBASH3BQ8TF42 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBASH3BQ8TF42 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBASH3BQ8TF42 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBASH3BQ8TF42 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBASH3BQ8TF42 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBASH3BQ8TF42 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBASH3BQ8TF42 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBASH3BQ8TF42 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBASH3BQ8TF42 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBASH3BQ8TF42 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBASH3BQ8TF42 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBASH3BQ8TF42 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBASH3BQ8TF42 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBASH3BQ8TF42 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBASH3BQ8TF42 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBASH3BQ8TF42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBASH3BQ8TF42 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBASH3BQ8TF42 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBASH3BQ8TF42 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBASH3BQ8TF42 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBASH3BQ8TF42 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3BQ8TF42 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBASH3BQ8TF42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3BQ8TF42 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3BQ8TF42 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3BQ8TF42 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3BQ8TF42 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3BQ8TF42 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3BQ8TF42 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBASH3BQ8TF42 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3BQ8TF42 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBASH3BQ8TF42 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBASH3BQ8TF42 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBASH3BQ8TF42 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBASH3BQ8TF42 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBASH3BQ8TF42 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBASH3BQ8TF42 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBASH3BQ8TF42 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBASH3BQ8TF42 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3BQ8TF42 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBASH3BQ8TF42 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBASH3BQ8TF42 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBASH3BQ8TF42 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBASH3BQ8TF42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBASH3BQ8TF42 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3BQ8TF42 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBASH3BQ8TF42 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3BQ8TF42 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBASH3BQ8TF42 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBASH3BQ8TF42 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBASH3BQ8TF42 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBASH3BQ8TF42 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBASH3BQ8TF42 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBASH3BQ8TF42 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBASH3BQ8TF42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBASH3BQ8TF42 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBASH3BQ8TF42 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBASH3BQ8TF42 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBASH3BQ8TF42 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3BQ8TF42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBASH3BQ8TF42 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBASH3BQ8TF42 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3BQ8TF42 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBASH3BQ8TF42 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBASH3BQ8TF42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBASH3BQ8TF42 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBASH3BQ8TF42 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBASH3BQ8TF42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBASH3BQ8TF42 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBASH3BQ8TF42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBASH3BQ8TF42 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBASH3BQ8TF42 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3BQ8TF42 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBASH3BQ8TF42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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