Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT9Q86SS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT9Q86SS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT9Q86SS6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT9Q86SS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYT9Q86SS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT9Q86SS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT9Q86SS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT9Q86SS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT9Q86SS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT9Q86SS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms