Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT9Q86SS6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYT9Q86SS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYT9Q86SS6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYT9Q86SS6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT9Q86SS6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYT9Q86SS6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT9Q86SS6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT9Q86SS6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT9Q86SS6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT9Q86SS6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT9Q86SS6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT9Q86SS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT9Q86SS6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT9Q86SS6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT9Q86SS6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT9Q86SS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT9Q86SS6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT9Q86SS6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT9Q86SS6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT9Q86SS6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT9Q86SS6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT9Q86SS6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYT9Q86SS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT9Q86SS6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT9Q86SS6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYT9Q86SS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYT9Q86SS6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT9Q86SS6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT9Q86SS6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYT9Q86SS6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYT9Q86SS6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYT9Q86SS6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT9Q86SS6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT9Q86SS6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT9Q86SS6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYT9Q86SS6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYT9Q86SS6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYT9Q86SS6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT9Q86SS6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYT9Q86SS6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT9Q86SS6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT9Q86SS6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT9Q86SS6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT9Q86SS6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT9Q86SS6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT9Q86SS6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT9Q86SS6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT9Q86SS6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT9Q86SS6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT9Q86SS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT9Q86SS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT9Q86SS6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT9Q86SS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT9Q86SS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT9Q86SS6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT9Q86SS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT9Q86SS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT9Q86SS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT9Q86SS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYT9Q86SS6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT9Q86SS6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT9Q86SS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT9Q86SS6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT9Q86SS6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT9Q86SS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYT9Q86SS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT9Q86SS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT9Q86SS6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT9Q86SS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT9Q86SS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT9Q86SS6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT9Q86SS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT9Q86SS6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT9Q86SS6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYT9Q86SS6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT9Q86SS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT9Q86SS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT9Q86SS6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT9Q86SS6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT9Q86SS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms