Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WDR53Q7Z5U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR53Q7Z5U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR53Q7Z5U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR53Q7Z5U6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WDR53Q7Z5U6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR53Q7Z5U6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR53Q7Z5U6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR53Q7Z5U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR53Q7Z5U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR53Q7Z5U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR53Q7Z5U6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR53Q7Z5U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms