Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LYSMD3Q7Z3D4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LYSMD3Q7Z3D4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LYSMD3Q7Z3D4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LYSMD3Q7Z3D4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LYSMD3Q7Z3D4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LYSMD3Q7Z3D4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LYSMD3Q7Z3D4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LYSMD3Q7Z3D4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms